Jogos de estratégia onde a principal função do jogador é fugir dos inimigos não é nenhuma novidade, mas alguns jogadores curtem muito este gênero, que já esteve presente em jogos famosos, como Metal Gear, dentre outros. Em Stealth Hunter 2 a principal missão do jogador é acessar diversos locais do cenário sem que os soldados que vigiam o local enxerguem o personagem.
O jogo roda direto do navegador e é bastante simples em termos de gráficos, mas quando comparado a outros webgames do gênero possui algumas novidades, principalmente o fato de apresentar pequenas animações com a preocupação de contar uma história, ao invés de simplesmente colocar o jogador em uma situação.
No início, o jogador poderá escolher as missões que quer enfrentar, mas vai precisar passar pelas primeiras antes de conseguir desbloquear as demais. O jogo também oferece algumas conquistas por tarefas que o jogador vai fazendo durante o percurso do game.
O jogador poderá controlar o personagem principal tanto com o mouse quanto com as setas do teclado. Na tela, aparece um mapa do local e também os inimigos que ficam circulando pelo cenário, bem como o campo de visão. Caso você entre no campo de visão do soldado, ele vai caçar seu personagem. É possível também eliminar os soldados caso o jogador consiga se aproximar sem ser visto.